MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 87478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017046	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494825
2	NC_017046	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	383494825
3	NC_017046	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494825
4	NC_017046	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	383494825
5	NC_017046	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494825
6	NC_017046	T	6	6	545	550	0 %	100 %	0 %	0 %	383494825
7	NC_017046	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	383494825
8	NC_017046	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494825
9	NC_017046	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
10	NC_017046	A	6	6	716	721	100 %	0 %	0 %	0 %	383494825
11	NC_017046	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	383494825
12	NC_017046	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
13	NC_017046	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
14	NC_017046	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494825
15	NC_017046	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
16	NC_017046	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
17	NC_017046	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494825
18	NC_017046	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494825
19	NC_017046	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	383494825
20	NC_017046	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494825
21	NC_017046	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494825
22	NC_017046	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494825
23	NC_017046	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494825
24	NC_017046	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
25	NC_017046	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494825
26	NC_017046	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383494825
27	NC_017046	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	383494825
28	NC_017046	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	383494825
29	NC_017046	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
30	NC_017046	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494825
31	NC_017046	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494825
32	NC_017046	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494825
33	NC_017046	AATATC	2	12	1606	1617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383494825
34	NC_017046	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494825
35	NC_017046	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494825
36	NC_017046	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494825
37	NC_017046	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494825
38	NC_017046	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494825
39	NC_017046	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494825
40	NC_017046	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494825
41	NC_017046	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494825
42	NC_017046	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494825
43	NC_017046	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494825
44	NC_017046	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494825
45	NC_017046	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
46	NC_017046	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494825
47	NC_017046	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494825
48	NC_017046	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	383494825
49	NC_017046	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	383494825
50	NC_017046	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	383494825
51	NC_017046	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	383494825
52	NC_017046	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494825
53	NC_017046	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
54	NC_017046	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494825
55	NC_017046	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	383494825
56	NC_017046	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494825
57	NC_017046	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494825
58	NC_017046	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494825
59	NC_017046	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494825
60	NC_017046	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494826
61	NC_017046	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494826
62	NC_017046	A	7	7	3060	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	383494826
63	NC_017046	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494826
64	NC_017046	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494826
65	NC_017046	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	383494826
66	NC_017046	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494826
67	NC_017046	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494826
68	NC_017046	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494826
69	NC_017046	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494826
70	NC_017046	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494826
71	NC_017046	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494826
72	NC_017046	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	383494826
73	NC_017046	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494826
74	NC_017046	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494826
75	NC_017046	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	383494826
76	NC_017046	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	383494826
77	NC_017046	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494826
78	NC_017046	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494826
79	NC_017046	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494827
80	NC_017046	T	8	8	3819	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	383494827
81	NC_017046	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494827
82	NC_017046	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494827
83	NC_017046	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	383494827
84	NC_017046	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494827
85	NC_017046	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494827
86	NC_017046	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	383494827
87	NC_017046	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494827
88	NC_017046	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	383494827
89	NC_017046	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494827
90	NC_017046	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494827
91	NC_017046	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494827
92	NC_017046	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494827
93	NC_017046	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494827
94	NC_017046	GCT	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494827
95	NC_017046	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494827
96	NC_017046	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	383494827
97	NC_017046	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	383494827
98	NC_017046	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	383494827
99	NC_017046	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383494827
100	NC_017046	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494827
101	NC_017046	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	383494827
102	NC_017046	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494827
103	NC_017046	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494827
104	NC_017046	CAG	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494827
105	NC_017046	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494827
106	NC_017046	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	383494827
107	NC_017046	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494827
108	NC_017046	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494827
109	NC_017046	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	383494827
110	NC_017046	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494827
111	NC_017046	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494827
112	NC_017046	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	383494828
113	NC_017046	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494828
114	NC_017046	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494828
115	NC_017046	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494828
116	NC_017046	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	383494828
117	NC_017046	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	383494828
118	NC_017046	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494828
119	NC_017046	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494828
120	NC_017046	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494828
121	NC_017046	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494828
122	NC_017046	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	383494828
123	NC_017046	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	383494828
124	NC_017046	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494828
125	NC_017046	CAAAAT	2	12	5578	5589	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383494828
126	NC_017046	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494828
127	NC_017046	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494828
128	NC_017046	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494828
129	NC_017046	AATCAG	2	12	5873	5884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383494828
130	NC_017046	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	383494829
131	NC_017046	GCC	2	6	5979	5984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494829
132	NC_017046	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494829
133	NC_017046	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494829
134	NC_017046	A	6	6	6266	6271	100 %	0 %	0 %	0 %	383494829
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